Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms