Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms