Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube3bQ9ES34 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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