Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pdzd9Q9D9M4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pdzd9Q9D9M4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pdzd9Q9D9M4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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