Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms