Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cfap53Q9D439 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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