Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.4 ms