Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms