Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms