Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sgo1Q9CXH7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sgo1Q9CXH7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sgo1Q9CXH7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sgo1Q9CXH7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sgo1Q9CXH7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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