Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cnih4Q9CX13 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cnih4Q9CX13 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cnih4Q9CX13 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cnih4Q9CX13 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih4Q9CX13 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnih4Q9CX13 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms