Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms