Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms