Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atxn3Q9CVD2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms