Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms