Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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