Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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