Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms