Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PccbQ99MN9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms