Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms