Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q99KU6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q99KU6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q99KU6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms