Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms