Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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