Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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