Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Csmd1Q923L3 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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