Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms