Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms