Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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