Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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