Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms