Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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