Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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