Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms