Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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