Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Negr1Q80Z24 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms