Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rexo1Q7TT28 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms