Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms