Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vstm2lQ6PDS0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms