Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg9bQ6EBV9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg9bQ6EBV9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atg9bQ6EBV9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg9bQ6EBV9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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