Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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