Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kiaa1549Q68FD9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms