Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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