Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms