Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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