Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk2a1Q60737 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms