Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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