Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28bQ45KJ6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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