Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms