Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Obox3Q3UT54 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Obox3Q3UT54 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Obox3Q3UT54 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Obox3Q3UT54 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Obox3Q3UT54 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms