Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms